Lhasa Apso este una dintre cele mai vechi rase de câini de companie, fiind crescută de călugării tibetani în mănăstirile acestora timp de secole. Istoria rasei este strâns legată de cea a Terrierului Tibetan însă, în timp ce Terrierul Tibetan era utilizat ca animal de lucru, Lhasa Apso, de talie mai mică, avea rol de câine de companie și de pază pentru mănăstiri și temple. Se presupune că exemplarele mai mici de Terrier Tibetan au fost oferite călugărilor și au constituit baza noii rase, deși această ipoteză nu este confirmată.
Călugării tibetani acordau o mare importanță acestor câini, considerându-i reîncarnări ale lamelor sfinte. Deținerea lor de către străini era interzisă, iar exemplarele nu erau vândute sau cumpărate, ci oferite exclusiv ca daruri. Primirea unui astfel de câine era considerată o mare onoare, fiind asociată cu norocul și prosperitatea.
Rasa a devenit cunoscută în afara Tibetului abia la începutul secolului al XX-lea, iar recunoașterea sa oficială în Regatul Unit a avut loc mult mai târziu.